Pro-tukipiste ry:n rahoitus koostuu pääosin julkisista avustuksista.

Vuonna 2020 rahoituslähteet olivat:

Sosiaali- ja terveysjärjestöjen avustuskeskus STEA (84,9 %)

Sosiaali- ja terveysministeriö (9,7 %)

Kuntien järjestöavustukset, Helsinki, Tampere ja Turku (4,6 %)

Yhteisvastuukeräyksen 2017 tuotto (0,5 %)

Muut, esimerkiksi jäsenmaksut, lahjoitukset (0,3 %)